SNP Profiles of "AMAZ 3 /2" View Data

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14
1. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GG	AT	___	GG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
2. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GT	TT	___	AG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
3. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GT	TT	___	AG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
4. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GT	TT	___	AG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
5. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GG	AT	___	GG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
6. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GG	AT	___	GG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
7. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GG	AT	___	GG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
8. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GG	AT	___	GG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
9. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GT	TT	___	AG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
10. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GG	AT	___	GG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
11. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GG	AT	___	GG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
12. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GG	AT	___	GG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
13. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GG	AT	___	GG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
14. _GC-03-022-2-11	___	___	GG	GG	AT	___	GG	___	___	CC	TT	CC	TT	___
15. _3211_7	___	___	GG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
16. _3211_8	___	___	GG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
17. _3211_9	___	___	GG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
18. _3211_12	___	___	GG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
19. _3211_13	___	___	GG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
20. _3211_15	___	___	GG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
21. _3211_16	___	___	GG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
22. _3211_1_>_FP	___	___	GG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
23. _3211_14_>_F	___	___	GG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
24. _3211_5_>_FP	___	___	GG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
25. _3211_2	___	___	GG	___	TT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
26. _3211_4	___	___	GG	___	TT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
27. _3211_3_>_FP	___	___	GG	___	TT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
28. _3211_10	___	___	GG	___	TT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
29. _RUQ_91	CT	AC	___	___	___	TT	___	CC	GG	___	___	___	___	TT
30. _RUQ_91	___	___	GG	CC	AT	___	GG	___	___	GG	AA	CC	AA	___
31. _RUQ_91	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	TT	CC	___	___
32. _RUQ_91	___	___	GG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
33. _P97_225	___	___	GG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___

	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28
1. _GC-03-022-2-11	___	AA	GT	CC	AT	GG	___	___	AA	___	GG	AA	GG	TT
2. _GC-03-022-2-11	___	AC	GG	CT	TT	GG	___	___	AC	___	CC	GG	GG	CT
3. _GC-03-022-2-11	___	AC	GG	CT	TT	GG	___	___	AC	___	CC	GG	GG	CT
4. _GC-03-022-2-11	___	AC	GG	CT	TT	GG	___	___	AC	___	CC	GG	GG	CT
5. _GC-03-022-2-11	___	AA	GT	CC	AT	GG	___	___	AA	___	GG	AA	GG	TT
6. _GC-03-022-2-11	___	AA	GT	___	AT	GG	___	___	AA	___	GG	AA	GG	TT
7. _GC-03-022-2-11	___	AA	GT	CC	AT	GG	___	___	AA	___	GG	AA	GG	TT
8. _GC-03-022-2-11	___	AA	GT	CC	AT	GG	___	___	AA	___	GG	AA	GG	TT
9. _GC-03-022-2-11	___	AC	GG	CT	TT	GG	___	___	AC	___	CC	GG	GG	CT
10. _GC-03-022-2-11	___	AA	GT	CC	AT	GG	___	___	AA	___	GG	AA	GG	TT
11. _GC-03-022-2-11	___	AA	GT	CC	AT	GG	___	___	AA	___	GG	AA	GG	TT
12. _GC-03-022-2-11	___	AA	GT	CC	AT	GG	___	___	AA	___	GG	AA	GG	TT
13. _GC-03-022-2-11	___	AA	GT	CC	AT	GG	___	___	AA	___	GG	AA	GG	TT
14. _GC-03-022-2-11	___	AA	GT	CC	AT	GG	___	___	AA	___	GG	AA	GG	TT
15. _3211_7	___	AA	GT	___	___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	TT
16. _3211_8	___	AA	GT	CC	___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	TT
17. _3211_9	___	AA	GT	CC	___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	TT
18. _3211_12	___	AA	GT	CC	___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	TT
19. _3211_13	___	AA	GT	CC	___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	TT
20. _3211_15	___	AA	GT	CC	___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	TT
21. _3211_16	___	AA	GT	CC	___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	TT
22. _3211_1_>_FP	___	AA	GT	CC	___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	TT
23. _3211_14_>_F	___	AA	GT	CC	___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	TT
24. _3211_5_>_FP	___	AA	GT	CC	___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	TT
25. _3211_2	___	AC	GG	CT	___	___	___	___	AC	___	CC	GG	___	CT
26. _3211_4	___	AC	GG	CT	___	___	___	___	AC	___	CC	GG	___	CT
27. _3211_3_>_FP	___	AC	GG	CT	___	___	___	___	AC	___	CC	GG	___	CT
28. _3211_10	___	AC	GG	CT	___	___	___	___	AC	___	CC	GG	___	CT
29. _RUQ_91	AA	AA	___	___	___	___	TT	AG	___	TT	___	AA	___	___
30. _RUQ_91	___	AA	AC	GG	AT	GG	___	___	AA	___	CC	AA	GG	AA
31. _RUQ_91	___	AA	GT	CC	___	GG	___	___	AA	___	GG	AA	___	-
32. _RUQ_91	___	AA	GT	CC	___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	TT
33. _P97_225	___	AA	GT	CC	___	___	___	___	AA	___	GG	AA	___	TT

	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42
1. _GC-03-022-2-11	___	___	AT	GG	___	GG	AT	CC	GG	___	GG	AA	CC	AA
2. _GC-03-022-2-11	___	___	AA	GG	___	GG	AT	CC	AG	___	GG	AA	CG	AG
3. _GC-03-022-2-11	___	___	AA	GG	___	GG	AT	CC	AG	___	GG	AA	CG	AG
4. _GC-03-022-2-11	___	___	AA	GG	___	GG	AT	CC	AG	___	GG	AA	CG	AG
5. _GC-03-022-2-11	___	___	AT	GG	___	GG	AT	CC	GG	___	GG	AA	CC	AA
6. _GC-03-022-2-11	___	___	AT	GG	___	GG	AT	CC	GG	___	GG	AA	CC	AA
7. _GC-03-022-2-11	___	___	AT	GG	___	GG	AT	CC	GG	___	GG	AA	CC	AA
8. _GC-03-022-2-11	___	___	AT	GG	___	GG	AT	CC	GG	___	GG	AA	CC	AA
9. _GC-03-022-2-11	___	___	AA	GG	___	GG	AT	CC	AG	___	GG	AA	CG	AG
10. _GC-03-022-2-11	___	___	AT	GG	___	GG	AT	CC	GG	___	GG	AA	CC	AA
11. _GC-03-022-2-11	___	___	AT	GG	___	GG	AT	CC	GG	___	GG	AA	CC	AA
12. _GC-03-022-2-11	___	___	AT	GG	___	GG	AT	CC	GG	___	GG	AA	CC	AA
13. _GC-03-022-2-11	___	___	AT	GG	___	GG	AT	CC	GG	___	GG	AA	CC	AA
14. _GC-03-022-2-11	___	___	AT	GG	___	GG	AT	CC	GG	___	GG	AA	CC	AA
15. _3211_7	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AA
16. _3211_8	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AA
17. _3211_9	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AA
18. _3211_12	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AA
19. _3211_13	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AA
20. _3211_15	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AA
21. _3211_16	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AA
22. _3211_1_>_FP	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AA
23. _3211_14_>_F	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AA
24. _3211_5_>_FP	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AA
25. _3211_2	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AG
26. _3211_4	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AG
27. _3211_3_>_FP	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AG
28. _3211_10	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AG
29. _RUQ_91	TT	AA	___	GG	AA	___	___	___	___	CT	___	___	___	___
30. _RUQ_91	___	___	AT	GG	___	GG	AT	GG	GG	___	GG	AA	GG	___
31. _RUQ_91	___	___	___	GG	___	GG	AT	___	___	___	___	___	-	-
32. _RUQ_91	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AA
33. _P97_225	___	___	___	___	___	___	AT	___	___	___	GG	___	___	AA

	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56
1. _GC-03-022-2-11	___	___	CC	___	CC	CC	___	AA	GG	AG	___	___	AA	TT
2. _GC-03-022-2-11	___	___	AA	___	CC	CT	___	AG	GG	GG	GG	___	AC	CC
3. _GC-03-022-2-11	___	___	AA	___	CC	CT	___	AG	GG	GG	GG	___	AC	CC
4. _GC-03-022-2-11	___	___	AA	___	CC	CT	___	AG	GG	GG	GG	___	AC	CC
5. _GC-03-022-2-11	___	___	CC	___	CC	CC	___	AA	GG	AG	___	___	AA	TT
6. _GC-03-022-2-11	___	___	CC	___	CC	CC	___	AA	GG	AG	___	___	AA	TT
7. _GC-03-022-2-11	___	___	CC	___	CC	CC	___	AA	GG	AG	___	___	AA	TT
8. _GC-03-022-2-11	___	___	CC	___	CC	CC	___	AA	GG	AG	___	___	AA	TT
9. _GC-03-022-2-11	___	___	AA	___	CC	CT	___	AG	GG	GG	GG	___	AC	CC
10. _GC-03-022-2-11	___	___	CC	___	CC	CC	___	AA	GG	AG	___	___	AA	TT
11. _GC-03-022-2-11	___	___	CC	___	CC	CC	___	AA	GG	AG	___	___	AA	TT
12. _GC-03-022-2-11	___	___	CC	___	CC	CC	___	AA	GG	AG	___	___	AA	TT
13. _GC-03-022-2-11	___	___	CC	___	CC	CC	___	AA	GG	AG	___	___	AA	TT
14. _GC-03-022-2-11	___	___	CC	___	CC	CC	___	AA	GG	AG	___	___	AA	TT
15. _3211_7	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	___	___	AA	___
16. _3211_8	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	___	___	AA	___
17. _3211_9	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	___	___	AA	___
18. _3211_12	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	___	___	AA	___
19. _3211_13	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	___	___	AA	___
20. _3211_15	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	___	___	AA	___
21. _3211_16	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	___	___	AA	___
22. _3211_1_>_FP	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	___	___	AA	___
23. _3211_14_>_F	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	___	___	AA	___
24. _3211_5_>_FP	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	___	___	AA	___
25. _3211_2	___	___	___	___	CC	CT	___	___	GG	___	GG	___	AC	___
26. _3211_4	___	___	___	___	CC	CT	___	___	GG	___	GG	___	AC	___
27. _3211_3_>_FP	___	___	___	___	CC	CT	___	___	GG	___	GG	___	AC	___
28. _3211_10	___	___	___	___	CC	CT	___	___	GG	___	GG	___	AC	___
29. _RUQ_91	___	AA	___	CC	CC	___	AA	___	___	___	___	AT	AA	TT
30. _RUQ_91	AA	___	CC	___	CC	___	___	AA	CC	AG	CC	___	AA	AA
31. _RUQ_91	___	___	___	___	CC	CC	___	___	-	___	CC	___	AA	TT
32. _RUQ_91	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	CC	___	AA	___
33. _P97_225	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	CC	___	AA	___

	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70
1. _GC-03-022-2-11	AA	CC	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	TT	GT	AA	___
2. _GC-03-022-2-11	AA	CT	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	CT	GG	GG	___
3. _GC-03-022-2-11	AA	CT	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	CT	GG	GG	___
4. _GC-03-022-2-11	AA	CT	___	___	___	___	AA	___	AA	TT	CT	GG	GG	___
5. _GC-03-022-2-11	AA	CC	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	TT	GT	AA	___
6. _GC-03-022-2-11	AA	CC	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	TT	GT	AA	___
7. _GC-03-022-2-11	AA	CC	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	TT	GT	AA	___
8. _GC-03-022-2-11	AA	CC	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	TT	GT	AA	___
9. _GC-03-022-2-11	AA	CT	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	CT	GG	GG	___
10. _GC-03-022-2-11	AA	CC	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	TT	GT	AA	___
11. _GC-03-022-2-11	AA	CC	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	TT	GT	AA	___
12. _GC-03-022-2-11	AA	CC	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	TT	GT	AA	___
13. _GC-03-022-2-11	AA	CC	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	TT	GT	AA	___
14. _GC-03-022-2-11	AA	CC	___	___	___	AA	AA	___	AA	TT	TT	GT	AA	___
15. _3211_7	___	CC	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GT	___	___
16. _3211_8	___	CC	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GT	___	___
17. _3211_9	___	CC	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GT	___	___
18. _3211_12	___	CC	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GT	___	___
19. _3211_13	___	CC	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GT	___	___
20. _3211_15	___	CC	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GT	___	___
21. _3211_16	___	CC	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GT	___	___
22. _3211_1_>_FP	___	CC	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GT	___	___
23. _3211_14_>_F	___	CC	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GT	___	___
24. _3211_5_>_FP	___	CC	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GT	___	___
25. _3211_2	___	CT	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GG	___	___
26. _3211_4	___	CT	___	___	___	___	___	___	___	___	___	GG	___	___
27. _3211_3_>_FP	___	CT	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GG	___	___
28. _3211_10	___	CT	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GG	___	___
29. _RUQ_91	___	___	TT	AA	CC	AA	___	CG	___	___	TT	GT	AA	CC
30. _RUQ_91	___	GG	___	___	___	___	AA	___	AA	___	___	AC	AA	___
31. _RUQ_91	___	CC	___	___	___	___	___	___	___	___	TT	GT	-	___
32. _RUQ_91	___	CC	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GT	___	___
33. _P97_225	___	CC	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	GT	___	___

	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84
1. _GC-03-022-2-11	TT	TT	TT	___	AA	___	CG	AA	CG	CG	CC	CC	GG	CT
2. _GC-03-022-2-11	TT	GG	TT	___	CC	___	CG	___	GG	CG	CT	CC	GG	CC
3. _GC-03-022-2-11	TT	GG	TT	___	CC	___	CG	___	GG	CG	CT	CC	GG	CC
4. _GC-03-022-2-11	TT	GG	TT	___	CC	___	CG	___	GG	CG	CT	CC	GG	CC
5. _GC-03-022-2-11	TT	TT	TT	___	AA	___	CG	AA	CG	CG	CC	CC	GG	CT
6. _GC-03-022-2-11	TT	TT	TT	___	AA	___	CG	AA	CG	CG	CC	CC	GG	CT
7. _GC-03-022-2-11	TT	TT	TT	___	AA	___	CG	AA	CG	CG	CC	CC	GG	CT
8. _GC-03-022-2-11	TT	TT	TT	___	AA	___	CG	AA	CG	CG	CC	CC	GG	CT
9. _GC-03-022-2-11	TT	GG	TT	___	CC	___	CG	___	GG	CG	CT	CC	GG	CC
10. _GC-03-022-2-11	TT	TT	TT	___	AA	___	CG	AA	CG	CG	CC	CC	GG	CT
11. _GC-03-022-2-11	TT	TT	TT	___	AA	___	CG	AA	CG	CG	CC	CC	GG	CT
12. _GC-03-022-2-11	TT	TT	TT	___	AA	___	CG	AA	CG	CG	CC	CC	GG	CT
13. _GC-03-022-2-11	TT	TT	TT	___	AA	___	CG	AA	CG	CG	CC	CC	GG	CT
14. _GC-03-022-2-11	TT	TT	TT	___	AA	___	CG	AA	CG	CG	CC	CC	GG	CT
15. _3211_7	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___	CT
16. _3211_8	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___	CT
17. _3211_9	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___	CT
18. _3211_12	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___	CT
19. _3211_13	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___	CT
20. _3211_15	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___	CT
21. _3211_16	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___	CT
22. _3211_1_>_FP	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___	CT
23. _3211_14_>_F	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___	CT
24. _3211_5_>_FP	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___	CT
25. _3211_2	___	___	___	___	___	___	___	___	GG	___	CT	___	___	CC
26. _3211_4	___	___	___	___	___	___	___	___	GG	___	CT	___	___	CC
27. _3211_3_>_FP	___	___	___	___	___	___	___	___	GG	___	CT	___	___	CC
28. _3211_10	___	___	___	___	___	___	___	___	GG	___	CT	___	___	CC
29. _RUQ_91	___	___	___	TT	AA	AA	TT	___	CG	___	___	___	GG	___
30. _RUQ_91	AA	AA	AA	___	AA	___	CG	AG	CG	___	GG	GG	GG	AG
31. _RUQ_91	___	___	TT	___	-	___	___	___	-	CG	CC	___	-	___
32. _RUQ_91	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___	CT
33. _P97_225	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___	CT

	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98
1. _GC-03-022-2-11	GG	CC	___	AT	CT	AA	CC	___	___	TT	CG	___	CC	GG
2. _GC-03-022-2-11	CG	CC	___	AA	CT	AG	CC	___	___	TT	CG	___	CC	AG
3. _GC-03-022-2-11	CG	CC	___	AA	CT	AG	CC	___	___	TT	CG	___	CC	AG
4. _GC-03-022-2-11	CG	CC	___	AA	CT	AG	CC	___	___	TT	CG	___	CC	AG
5. _GC-03-022-2-11	GG	CC	___	AT	CT	AA	CC	___	___	TT	CG	___	CC	GG
6. _GC-03-022-2-11	GG	CC	___	AT	CT	AA	CC	___	___	TT	CG	___	CC	GG
7. _GC-03-022-2-11	GG	CC	___	AT	CT	AA	CC	___	___	TT	CG	___	CC	GG
8. _GC-03-022-2-11	GG	CC	___	AT	CT	AA	CC	___	___	TT	CG	___	CC	GG
9. _GC-03-022-2-11	CG	CC	___	AA	CT	AG	CC	___	___	TT	CG	___	CC	AG
10. _GC-03-022-2-11	GG	CC	___	AT	CT	AA	CC	___	___	TT	CG	___	CC	GG
11. _GC-03-022-2-11	GG	CC	___	AT	CT	AA	CC	___	___	TT	CG	___	CC	GG
12. _GC-03-022-2-11	GG	CC	___	AT	CT	AA	CC	___	___	TT	CG	___	CC	GG
13. _GC-03-022-2-11	GG	CC	___	AT	CT	AA	CC	___	___	TT	CG	___	CC	GG
14. _GC-03-022-2-11	GG	CC	___	AT	CT	AA	CC	___	___	TT	CG	___	CC	GG
15. _3211_7	GG	___	___	AT	CT	AA	___	___	___	___	___	___	CC	GG
16. _3211_8	GG	___	___	AT	CT	AA	___	___	___	___	___	___	CC	GG
17. _3211_9	GG	___	___	AT	CT	AA	___	___	___	___	___	___	CC	GG
18. _3211_12	GG	___	___	AT	CT	AA	___	___	___	___	___	___	CC	GG
19. _3211_13	GG	___	___	AT	CT	AA	___	___	___	___	___	___	CC	GG
20. _3211_15	GG	___	___	AT	CT	AA	___	___	___	___	___	___	CC	GG
21. _3211_16	GG	___	___	AT	CT	AA	___	___	___	___	___	___	CC	GG
22. _3211_1_>_FP	GG	___	___	AT	CT	AA	___	___	___	___	___	___	CC	GG
23. _3211_14_>_F	GG	___	___	AT	CT	AA	___	___	___	___	___	___	CC	GG
24. _3211_5_>_FP	GG	___	___	AT	CT	AA	___	___	___	___	___	___	CC	GG
25. _3211_2	CG	___	___	AA	CT	AG	___	___	___	___	___	___	CC	AG
26. _3211_4	CG	___	___	AA	CT	AG	___	___	___	___	___	___	CC	AG
27. _3211_3_>_FP	CG	___	___	AA	CT	AG	___	___	___	___	___	___	CC	AG
28. _3211_10	CG	___	___	AA	CT	AG	___	___	___	___	___	___	CC	AG
29. _RUQ_91	___	___	CC	___	___	AA	CC	CC	AA	___	___	CC	___	GG
30. _RUQ_91	GG	GG	___	AT	AG	AA	___	___	___	AA	___	___	GG	GG
31. _RUQ_91	___	___	___	___	___	AA	-	___	___	___	___	___	CC	___
32. _RUQ_91	GG	___	___	AT	CT	AA	___	___	___	___	___	___	CT	GG
33. _P97_225	GG	___	___	AT	CT	AA	___	___	___	___	___	___	CC	GG

	99	100	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112
1. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CC	GG	___	TT	CC	TT	CT	CT	GT	___	___	AC
2. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CT	AG	___	TT	CC	TT	TT	CC	GG	___	___	CC
3. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CT	AG	___	TT	CC	TT	TT	CC	GG	___	___	CC
4. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CT	AG	___	TT	CC	TT	TT	CC	GG	___	___	CC
5. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CC	GG	___	TT	CC	TT	CT	CT	GT	___	___	AC
6. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CC	GG	___	TT	CC	TT	CT	CT	GT	___	___	AC
7. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CC	GG	___	TT	CC	TT	CT	CT	GT	___	___	AC
8. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CC	GG	___	TT	CC	TT	CT	CT	GT	___	___	AC
9. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CT	AG	___	TT	CC	TT	TT	CC	GG	___	___	CC
10. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CC	GG	___	TT	CC	TT	CT	CT	GT	___	___	AC
11. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CC	GG	___	TT	CC	TT	CT	CT	GT	___	___	AC
12. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CC	GG	___	TT	CC	TT	CT	CT	GT	___	___	AC
13. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CC	GG	___	TT	CC	TT	CT	CT	GT	___	___	AC
14. _GC-03-022-2-11	GG	AA	CC	GG	___	TT	CC	TT	CT	CT	GT	___	___	AC
15. _3211_7	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CT	___	___	___	___
16. _3211_8	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CT	___	___	___	___
17. _3211_9	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CT	___	___	___	___
18. _3211_12	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CT	___	___	___	___
19. _3211_13	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CT	___	___	___	___
20. _3211_15	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CT	___	___	___	___
21. _3211_16	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CT	___	___	___	___
22. _3211_1_>_FP	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CT	___	___	___	___
23. _3211_14_>_F	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CT	___	___	___	___
24. _3211_5_>_FP	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CT	___	___	___	___
25. _3211_2	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CC	___	___	___	___
26. _3211_4	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CC	___	___	___	___
27. _3211_3_>_FP	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CC	___	___	___	___
28. _3211_10	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CC	___	___	___	___
29. _RUQ_91	___	___	___	___	CC	___	CC	___	___	___	___	GT	AA	___
30. _RUQ_91	CC	AA	GG	GG	___	___	___	AA	AG	___	AC	___	___	___
31. _RUQ_91	GG	___	___	AA	___	TT	___	___	___	___	___	___	___	___
32. _RUQ_91	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CT	___	___	___	___
33. _P97_225	___	AA	___	___	___	___	CC	___	___	CT	___	___	___	___

	113	114	115	116	117	118	119	120	121	122	123	124	125	126
1. _GC-03-022-2-11	TT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	AA
2. _GC-03-022-2-11	GT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	AG
3. _GC-03-022-2-11	GT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	AG
4. _GC-03-022-2-11	GT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	AG
5. _GC-03-022-2-11	TT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	AA
6. _GC-03-022-2-11	TT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	AA
7. _GC-03-022-2-11	TT	TT	___	___	TT	___	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	AA
8. _GC-03-022-2-11	TT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	___	CC	TT	CC	AA
9. _GC-03-022-2-11	GT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	AG
10. _GC-03-022-2-11	TT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	AA
11. _GC-03-022-2-11	TT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	AA
12. _GC-03-022-2-11	TT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	AA
13. _GC-03-022-2-11	TT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	AA
14. _GC-03-022-2-11	TT	TT	___	___	TT	AA	GG	___	___	TT	CC	TT	CC	___
15. _3211_7	TT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AA
16. _3211_8	TT	TT	___	___	___	___	___	___	___	TT	___	TT	CC	AA
17. _3211_9	TT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	___	___	TT	CC	AA
18. _3211_12	TT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AA
19. _3211_13	TT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AA
20. _3211_15	TT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AA
21. _3211_16	TT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	___
22. _3211_1_>_FP	TT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AA
23. _3211_14_>_F	TT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AA
24. _3211_5_>_FP	TT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AA
25. _3211_2	GT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AG
26. _3211_4	GT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AG
27. _3211_3_>_FP	GT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AG
28. _3211_10	GT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AG
29. _RUQ_91	TT	___	GG	AT	___	___	___	AG	GG	___	___	___	CC	___
30. _RUQ_91	AA	AA	___	___	AA	AA	GG	___	___	AA	GG	AA	GG	AA
31. _RUQ_91	TT	___	___	___	TT	___	___	___	___	___	-	-	CC	AA
32. _RUQ_91	TT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AG
33. _P97_225	TT	TT	___	___	___	AA	___	___	___	TT	___	TT	CC	AA

	127	128	129	130	131	132	133	134
1. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	AC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
2. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	CC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
3. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	CC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
4. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	CC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
5. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	AC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
6. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	AC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
7. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	AC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
8. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	AC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
9. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	CC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
10. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	AC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
11. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	AC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
12. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	AC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
13. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	AC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
14. _GC-03-022-2-11	CC	___	___	CC	AA	AC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
15. _3211_7	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
16. _3211_8	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
17. _3211_9	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
18. _3211_12	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
19. _3211_13	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
20. _3211_15	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
21. _3211_16	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
22. _3211_1_>_FP	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
23. _3211_14_>_F	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
24. _3211_5_>_FP	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
25. _3211_2	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
26. _3211_4	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
27. _3211_3_>_FP	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
28. _3211_10	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
29. _RUQ_91	___	TT	TT	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
30. _RUQ_91	GG	___	___	CC	___	AC	AA	CC	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
31. _RUQ_91	___	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
32. _RUQ_91	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
33. _P97_225	CC	___	___	___	___	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X

Mars Center for Cocoa Science Brazil

1._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 1

Notes: 1 > FP4

2._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 2

Notes: 2

3._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 3

Notes: 3 > FP3

4._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 4

Notes: 4

5._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 5

Notes: 5 > FP4

6._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 7

Notes: 7

7._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 8

Notes: 8

8._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 9

Notes: 9

9._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 10

Notes: 10

10._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 12

Notes: 12

11._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 13

Notes: 13

12._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 14

Notes: 14 > FP2

13._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 15

Notes: 15

14._AMAZ_3_/2 GC-03-022-2-11

Location: Tree: 16

Notes: 16

15._AMAZ_3_/2

Location: 3211 7

Dapeng Zhang, 2016

16._AMAZ_3_/2

Location: 3211 8

Dapeng Zhang, 2016

Population Assignment:

Dapeng Zhang, 2016

17._AMAZ_3_/2

Location: 3211 9

Dapeng Zhang, 2016

18._AMAZ_3_/2

Location: 3211 12

Dapeng Zhang, 2016

19._AMAZ_3_/2

Location: 3211 13

Dapeng Zhang, 2016

20._AMAZ_3_/2

Location: 3211 15

Dapeng Zhang, 2016

21._AMAZ_3_/2

Location: 3211 16

Dapeng Zhang, 2016

22._AMAZ_3_/2

Location: 3211 1 > FP

Dapeng Zhang, 2016

23._AMAZ_3_/2

Location: 3211 14 > F

Dapeng Zhang, 2016

24._AMAZ_3_/2

Location: 3211 5 > FP

Dapeng Zhang, 2016

25._AMAZ_3_/2

Location: 3211 2

Dapeng Zhang, 2016

Population Assignment:

Dapeng Zhang, 2016

26._AMAZ_3_/2

Location: 3211 4

Dapeng Zhang, 2016

27._AMAZ_3_/2

Location: 3211 3 > FP

Dapeng Zhang, 2016

28._AMAZ_3_/2

Location: 3211 10

Dapeng Zhang, 2016

International Cocoa Quarantine Centre, Reading (ICQC,R) United Kingdom

29._AMAZ_3_/2 RUQ 91

Lambert Motilal, 2023

30._AMAZ_3_/2 RUQ 91

Notes: Reading_Collection

31._AMAZ_3_/2 RUQ 91

Dapeng Zhang, 2014

32._AMAZ_3_/2 RUQ 91

Dapeng Zhang, 2016

Cocoa Research Institute of Ghana (CRIG) Ghana

33._AMAZ_3_/2

Location: P97 225

Dapeng Zhang, 2016

Key to SNP Markers

Key to SNP Markers

1	TcSNP13	2	TcSNP19	3	TcSNP25	4	TcSNP28	5	TcSNP32
6	TcSNP33	7	TcSNP42	8	TcSNP49	9	TcSNP52	10	TcSNP60
11	TcSNP75	12	TcSNP90	13	TcSNP122	14	TcSNP131	15	TcSNP143
16	TcSNP144	17	TcSNP150	18	TcSNP151	19	TcSNP154	20	TcSNP174
21	TcSNP176	22	TcSNP189	23	TcSNP193	24	TcSNP194	25	TcSNP226
26	TcSNP230	27	TcSNP240	28	TcSNP242	29	TcSNP290	30	TcSNP305
31	TcSNP316	32	TcSNP329	33	TcSNP363	34	TcSNP364	35	TcSNP372
36	TcSNP413	37	TcSNP418	38	TcSNP421	39	TcSNP429	40	TcSNP430
41	TcSNP448	42	TcSNP469	43	TcSNP497	44	TcSNP519	45	TcSNP521
46	TcSNP522	47	TcSNP529	48	TcSNP534	49	TcSNP546	50	TcSNP547
51	TcSNP560	52	TcSNP561	53	TcSNP577	54	TcSNP589	55	TcSNP591
56	TcSNP602	57	TcSNP606	58	TcSNP619	59	TcSNP640	60	TcSNP642
61	TcSNP644	62	TcSNP645	63	TcSNP653	64	TcSNP660	65	TcSNP689
66	TcSNP701	67	TcSNP702	68	TcSNP723	69	TcSNP731	70	TcSNP739
71	TcSNP751	72	TcSNP776	73	TcSNP799	74	TcSNP800	75	TcSNP823
76	TcSNP835	77	TcSNP836	78	TcSNP860	79	TcSNP872	80	TcSNP878
81	TcSNP891	82	TcSNP894	83	TcSNP899	84	TcSNP917	85	TcSNP929
86	TcSNP944	87	TcSNP945	88	TcSNP953	89	TcSNP994	90	TcSNP998
91	TcSNP999	92	TcSNP1010	93	TcSNP1019	94	TcSNP1034	95	TcSNP1041
96	TcSNP1053	97	TcSNP1060	98	TcSNP1062	99	TcSNP1063	100	TcSNP1075
101	TcSNP1096	102	TcSNP1111	103	TcSNP1112	104	TcSNP1126	105	TcSNP1144
106	TcSNP1149	107	TcSNP1156	108	TcSNP1165	109	TcSNP1175	110	TcSNP1205
111	TcSNP1230	112	TcSNP1242	113	TcSNP1253	114	TcSNP1270	115	TcSNP1275
116	TcSNP1293	117	TcSNP1309	118	TcSNP1350	119	TcSNP1383	120	TcSNP1401
121	TcSNP1404	122	TcSNP1414	123	TcSNP1439	124	TcSNP1442	125	TcSNP1458
126	TcSNP1484	127	TcSNP1520	128	TcSNP1524	129	TcSNP1527	130	Tcm001s00947643
131	Tcm002s20575712	132	Tcm003s01336581	133	Tcm003s07402719	134	Tcm006s26664133