SNP Profiles matching ICS 1

 Show/Hide Profiles

 Key

 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14
_Input profile
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
1._ICS_1
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
2._ICS_1
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
3._ICS_1
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
4._ICS_1
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
5._ICS_1
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
6._NA
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
7._NA
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
8._NA
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
9._NA
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
10._NA
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
11._PA_70_[PER]
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
12._GC-04-053-3-17
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
13._ICS_1
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
14._NA
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
15._MARPER_45
TTAAGGCT__AACC__CT__AAAA__AG
16._RUQ_847
TTAGGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
17._RUQ_847
__AAGGCT______TT________TTAG
18._RUQ_817
__AAGGCT______TT________TTAG
19._RUQ_847
TTAGGGCTTTAACCTTCTCTAAAATTAG
20._OC_61_[VEN]
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
21._OC_61_[VEN]
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
22._GC-05-039-1-39
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
23._GC-05-039-1-39
TTAAGGCTTTAACCTTCTTTAAAATTAG
24._MARPER_34
TTAAGGTT__AACC__CT__AAAA__AG
25._MARPER_55
TTAAGGCT__AACC__CT__AAAA__AG
 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28
_Input profile
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
1._ICS_1
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
2._ICS_1
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
3._ICS_1
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
4._ICS_1
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
5._ICS_1
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
6._NA
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
7._NA
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
8._NA
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
9._NA
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
10._NA
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
11._PA_70_[PER]
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
12._GC-04-053-3-17
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
13._ICS_1
TTAAGGTTCCGTGGTTAC__TTTTCCGG
14._NA
TTAAGGTTCCGTGGTTAC__TTTTCCGG
15._MARPER_45
TTAAGG__CCGTGGTT__CC__TTCCGG
16._RUQ_847
TTAAGGTTCCGTGGTTACCCTTTTCCGG
17._RUQ_847
________CCGT__TTAACCTTTTCC__
18._RUQ_817
________CCGT__TTAACCTTTTCC__
19._RUQ_847
TTAAGGTTCCGTGGCTACCCTTCTCCGG
20._OC_61_[VEN]
TTAAGGTTCCGGGGTTCCCCTTTTCCGG
21._OC_61_[VEN]
TTAAGGTTCCGGGGTTCCCCTTTTCCGG
22._GC-05-039-1-39
TTAAGGTTCCGGGGTTCCCCTTTTCCGG
23._GC-05-039-1-39
TTAAGGTTCCGGGGTTCCCCTTTTCCGG
24._MARPER_34
TTAAGG__CCGTGGCT__CC__CTCCGG
25._MARPER_55
TTAAGG__CCGTGGCT__CC__CTCCGG
 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38     
_Input profile
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
1._ICS_1
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
2._ICS_1
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
3._ICS_1
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
4._ICS_1
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
5._ICS_1
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
6._NA
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
7._NA
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
8._NA
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
9._NA
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
10._NA
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
11._PA_70_[PER]
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
12._GC-04-053-3-17
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
13._ICS_1
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
14._NA
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
15._MARPER_45
__CTAG______GT__AT__X_XX_XX_XX_X
16._RUQ_847
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
17._RUQ_847
ATCTAGCGAACCGTAA____X_XX_XX_XX_X
18._RUQ_817
ATCTAGCGAACCGTAA____X_XX_XX_XX_X
19._RUQ_847
ATCTAGCGAACCGTAAATGGX_XX_XX_XX_X
20._OC_61_[VEN]
AACCAGCGAACCTTACTTGGX_XX_XX_XX_X
21._OC_61_[VEN]
AACCAGCGAACCTTACTTGGX_XX_XX_XX_X
22._GC-05-039-1-39
AACCAGCGAACCTTACTTGGX_XX_XX_XX_X
23._GC-05-039-1-39
AACCAGCGAACCTTACTTGGX_XX_XX_XX_X
24._MARPER_34
__TTAG______GT__AA__X_XX_XX_XX_X
25._MARPER_55
__CCAA______GG__AT__X_XX_XX_XX_X

Input profile: ICS_1

 
International Cocoa Genebank, Trinidad (ICG,T), Trinidad and Tobago
Location: San Juan Block4