SNP Profiles matching UF 712

 Show/Hide Profiles

 Key

 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14
_Input profile
TTCCCCGGTTGGCCCCAACCAAGGTTCC
1._RUQ_1638
TTCCCCGGTTGGCCCCAACCAAGGTTCC
2._GC-01-089-5-06
TTCCCCGGTTGGCCCCAACCAAGGTTCC
3._GC-01-089-5-06
TTCCCCGGTTGGCCCCAACCAAGGTTCC
4._GC-01-089-5-06
TTCCCCGGTTGGCCCCAACCAAGGTTCC
5._GC-01-089-5-06
TTCCCCGGTTGGCCCCAACCAAGGTTCC
6._UF_712
____CCGGTT__CCCCAACC____TT__
7._UF_712
____CCGGTT__CCCCAACC____TT__
8._UF_712
____CCGGTT__CCCCAACC____TT__
9._UF_712
____CCGGTT__CCCCAACC____TT__
10._RUQ_1638
____CCGGTT__CCCCAACC____TT__
11._RUQ_1638
____CCGGTT__CCCCAACC____TT__
12._UF_712
____CCGGTT__CCCCAACC____TT__
13._LCT_EEN_90
____CCGGTT__CC__AACC____TT__
14._LCT_EEN_90
____CCGGTT__CC__AACC____TT__
15._UF_712
____CCGGTT__CCCC__CC____TT__
16._GC-08-089-2-12
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
17._GC-08-089-2-12
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
18._GC-08-089-2-12
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
19._GC-08-089-2-12
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
20._GC-08-089-2-12
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
21._GC-08-089-2-12
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
22._GC-08-089-2-12
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
23._GC-08-089-2-12
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
24._GC-08-089-2-12
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
25._GC-05-069-2-20
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
26._GC-05-069-2-20
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
27._GC-05-069-2-20
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
28._GC-08-089-2-12
TTCCCCGGTTGGCCGGAACCAGGGTTCC
29._LCT_EEN_280
____ACGGTT__CCCCAGCC____TT__
30._LCT_EEN_280
____ACGGTT__CCCCAGCC____TT__
31._LCT_EEN_280
____ACGGTT__CCCCAGCC____TT__
32._LCT_EEN_280
____ACGGTT__CCCCAGCC____TT__
33._LCT_EEN_280
____ACGGTT__CCCCAGCC____TT__
34._LCT_EEN_280
____ACGGTT__CCCCAGCC____TT__
35._LCT_EEN_280
____ACGGTT__CCCCAGCC____TT__
36._LCT_EEN_280
____ACGGTT__CCCCAGCC____TT__
37._LCT_EEN_90
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
38._LCT_EEN_90
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
39._LCT_EEN_90
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
40._LCT_EEN_90
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
41._LCT_EEN_90
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
42._LCT_EEN_90
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
43._LCT_EEN_90
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
44._LCT_EEN_90
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
45._LCT_EEN_90
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
46._LCT_EEN_90
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
47._POUND_10
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
48._POUND_10
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
49._POUND_10
____CCGGTT__CCGGAACC____TT__
50._LCT_EEN_267
____ACGGTT__CC__AACC____TT__
51._LCT_EEN_84
____ACGGTT__CC__AGCC____TT__
52._LCT_EEN_85
____AAGGTT__CC____CC____TT__
53._LCT_EEN_280
____ACGGTT__CC__AGCC____TT__
54._RUQ_1379
TTCCCCGGTTGGCCCCAACCAGGGTTCG
55._RUQ_469
TTCCCCGGTTGGCCCCAACCAGGGTTCG
56._LCT_EEN_66
____ACGGTT__CC__AACC____TT__
57._LCT_EEN_81
____ACGGTT__CC__AACC____TT__
 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28
_Input profile
GGAACCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
1._RUQ_1638
GGAACCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
2._GC-01-089-5-06
GGAACCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
3._GC-01-089-5-06
GGAACCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
4._GC-01-089-5-06
GGAACCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
5._GC-01-089-5-06
GGAACCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
6._UF_712
GGAACCGGGGCC__CT__GG______GG
7._UF_712
GGAACCGGGGCC__CT__GG______GG
8._UF_712
GGAACCGGGGCC__CT__GG______GG
9._UF_712
GGAACCGGGGCC__CT__GG______GG
10._RUQ_1638
GGAACCGGGGCC__CT__GG______GG
11._RUQ_1638
GGAACCGGGGCC__CT__GG______GG
12._UF_712
GGAACCGGGGCC__CT__GG______GG
13._LCT_EEN_90
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
14._LCT_EEN_90
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
15._UF_712
GGAACCGGGGTT__CT__GG______GG
16._GC-08-089-2-12
GGACCCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
17._GC-08-089-2-12
GGACCCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
18._GC-08-089-2-12
GGACCCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
19._GC-08-089-2-12
GGACCCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
20._GC-08-089-2-12
GGACCCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
21._GC-08-089-2-12
GGACCCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
22._GC-08-089-2-12
GGACCCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
23._GC-08-089-2-12
GGACCCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
24._GC-08-089-2-12
GGACCCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
25._GC-05-069-2-20
GGACCCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
26._GC-05-069-2-20
GGACCCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
27._GC-05-069-2-20
GGACCCGGGGCCCCCTTTGGAATTCCGG
28._GC-08-089-2-12
GGACCCGGGGCCCCCT__GGAATTCCGG
29._LCT_EEN_280
GGAACCGGGGCC__CT__GG______CG
30._LCT_EEN_280
GGAACCGGGGCC__CT__GG______CG
31._LCT_EEN_280
GGAACCGGGGCC__CT__GG______CG
32._LCT_EEN_280
GGAACCGGGGCC__CT__GG______CG
33._LCT_EEN_280
GGAACCGGGGCC__CT__GG______CG
34._LCT_EEN_280
GGAACCGGGGCC__CT__GG______CG
35._LCT_EEN_280
GGAACCGGGGCC__CT__GG______CG
36._LCT_EEN_280
GGAACCGGGGCC__CT__GG______CG
37._LCT_EEN_90
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
38._LCT_EEN_90
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
39._LCT_EEN_90
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
40._LCT_EEN_90
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
41._LCT_EEN_90
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
42._LCT_EEN_90
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
43._LCT_EEN_90
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
44._LCT_EEN_90
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
45._LCT_EEN_90
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
46._LCT_EEN_90
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
47._POUND_10
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
48._POUND_10
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
49._POUND_10
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
50._LCT_EEN_267
GGACCCGGGGCC__CT__GG______CG
51._LCT_EEN_84
GGACCCGGGGCC__CT__GG______GG
52._LCT_EEN_85
GGAACCGGGGCC__CT__GG______CG
53._LCT_EEN_280
GGAACCGGGGCC__CT__GG______CG
54._RUQ_1379
GGAACCGTGGCCCCCTTTGGAGGTCCGG
55._RUQ_469
GGAACCGTGGCCCCCTTTGGAGGTCCGG
56._LCT_EEN_66
GGAACCGGGGCC__CT__GG______CC
57._LCT_EEN_81
GGAACCGGGGCC__CT__GG______CC
 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42
_Input profile
GGTTAACCCCGGGGTTGGCCCCTTCCGG
1._RUQ_1638
GGTTAACCCCGGGGTTGGCCCCTTCCGG
2._GC-01-089-5-06
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
3._GC-01-089-5-06
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
4._GC-01-089-5-06
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
5._GC-01-089-5-06
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTT__GG
6._UF_712
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
7._UF_712
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
8._UF_712
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
9._UF_712
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
10._RUQ_1638
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
11._RUQ_1638
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
12._UF_712
__TTAA__CC______GG____TT__GG
13._LCT_EEN_90
GGTTAA__CC______GG____TTCCGG
14._LCT_EEN_90
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
15._UF_712
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
16._GC-08-089-2-12
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
17._GC-08-089-2-12
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
18._GC-08-089-2-12
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
19._GC-08-089-2-12
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
20._GC-08-089-2-12
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
21._GC-08-089-2-12
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
22._GC-08-089-2-12
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
23._GC-08-089-2-12
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
24._GC-08-089-2-12
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
25._GC-05-069-2-20
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
26._GC-05-069-2-20
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
27._GC-05-069-2-20
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
28._GC-08-089-2-12
GGTTAACCCCGGGGTTGG__CCTTCCGG
29._LCT_EEN_280
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
30._LCT_EEN_280
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
31._LCT_EEN_280
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
32._LCT_EEN_280
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
33._LCT_EEN_280
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
34._LCT_EEN_280
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
35._LCT_EEN_280
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
36._LCT_EEN_280
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
37._LCT_EEN_90
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
38._LCT_EEN_90
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
39._LCT_EEN_90
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
40._LCT_EEN_90
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
41._LCT_EEN_90
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
42._LCT_EEN_90
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
43._LCT_EEN_90
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
44._LCT_EEN_90
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
45._LCT_EEN_90
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
46._LCT_EEN_90
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
47._POUND_10
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
48._POUND_10
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
49._POUND_10
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
50._LCT_EEN_267
GGTTAA__CC______GG____TTCCGG
51._LCT_EEN_84
GGTTAA__CC______GG____TTCCGG
52._LCT_EEN_85
GGTTAA__CC______GG____TTCCGG
53._LCT_EEN_280
__TTAA__CC______GG____TTCCGG
54._RUQ_1379
GGTTAACCCCGGGGTTGTCCCCTTCCGG
55._RUQ_469
GGTTAACCCCGGGGTTGTCCCCTTCCGG
56._LCT_EEN_66
GGTTAA__CC______GG____CTCCGG
57._LCT_EEN_81
GGTTAA__CC______GG____CTCCGG

Input profile: UF_712 RUQ_1683

 
International Cocoa Quarantine Centre, Reading (ICQC,R), United Kingdom