SNP Profiles of "SCA 9" View Data

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14
1. _SCA9	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___
2. _RUQ_1064	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___
3. _RUQ_1064	CT	CC	___	___	___	TT	___	CC	GG	___	___	___	___	GG
4. _RUQ_1064	___	___	GG	CC	AT	___	GG	___	___	GG	AA	CC	AA	___
5. _RUQ_1064	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	TT	CC	___	___

	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28
1. _SCA9	___	CC	___	CT	___	___	___	___	___	___	GG	AG	___	___
2. _RUQ_1064	___	AC	___	CC	___	GG	___	___	AA	___	CG	AG	___	___
3. _RUQ_1064	AT	AC	___	___	___	___	TT	AG	___	GG	___	AG	___	___
4. _RUQ_1064	___	AC	CC	GG	AT	GG	___	___	AA	___	CG	AG	GG	AG
5. _RUQ_1064	___	AC	GG	CC	___	GG	___	___	AA	___	CG	AG	___	CT

	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42
1. _SCA9	___	___	___	___	___	AG	AA	CC	___	___	___	___	CC	___
2. _RUQ_1064	___	___	___	___	___	GG	AT	CT	___	___	___	___	CC	___
3. _RUQ_1064	CT	AA	___	GG	AA	___	___	___	___	CC	___	___	___	___
4. _RUQ_1064	___	___	TT	GG	___	GG	AT	AG	GG	___	GG	AA	GG	___
5. _RUQ_1064	___	___	___	GG	___	GG	AT	___	___	___	___	___	CC	AA

	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56
1. _SCA9	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	CG	___	CC	CT
2. _RUQ_1064	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	GG	___	AA	CC
3. _RUQ_1064	___	AC	___	CC	CC	___	AA	___	___	___	GG	AT	AA	CC
4. _RUQ_1064	AA	___	AA	___	CC	___	___	AA	CC	GG	GG	___	AA	GG
5. _RUQ_1064	___	___	___	___	CC	CC	___	___	GG	___	GG	___	AA	CC

	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70
1. _SCA9	GG	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	TT
2. _RUQ_1064	AA	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	___	TT
3. _RUQ_1064	___	___	TT	AG	CC	AA	___	CC	___	TT	GG	GG	CT	___
4. _RUQ_1064	___	AG	___	___	___	___	AA	___	AA	___	CC	GG	___	AA
5. _RUQ_1064	___	CT	___	___	___	___	___	___	___	TT	GG	GG	___	___

	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84
1. _SCA9	___	___	___	___	___	___	AA	GG	CG	CT	___	___	___	___
2. _RUQ_1064	___	___	___	___	___	___	GG	GG	GG	CT	___	___	___	___
3. _RUQ_1064	___	___	TT	AC	TT	TT	___	CC	___	___	___	GG	___	___
4. _RUQ_1064	AC	AA	___	AC	___	CC	GG	GG	___	AG	GG	GG	AG	GG
5. _RUQ_1064	___	TT	___	AC	___	___	___	CC	CC	TT	___	-	___	___

	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98
1. _SCA9	___	___	___	CT	___	___	___	___	___	CC	___	CT	___	___
2. _RUQ_1064	___	___	___	CT	___	___	___	___	___	CG	___	CC	___	___
3. _RUQ_1064	___	CC	___	___	AG	CC	CC	AA	___	___	CC	___	AG	___
4. _RUQ_1064	GG	___	AA	AG	AG	___	___	___	AA	___	___	GG	AG	CC
5. _RUQ_1064	___	___	___	___	AG	CC	___	___	___	___	___	CC	___	GG

	99	100	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112
1. _SCA9	___	___	AG	___	AT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
2. _RUQ_1064	___	___	GG	___	TT	___	___	___	___	___	___	___	___	___
3. _RUQ_1064	___	___	___	TT	___	CC	___	___	___	GG	AA	TT	___	GG
4. _RUQ_1064	AA	GG	GG	___	___	___	AA	AA	AC	___	___	AA	AA	___
5. _RUQ_1064	___	___	GG	___	TT	___	___	___	___	___	___	TT	___	___

	113	114	115	116	117	118	119	120	121	122	123	124	125	126
1. _SCA9	___	___	___	___	___	___	CT	___	GG	___	___	___	___	___
2. _RUQ_1064	___	___	___	___	___	___	CC	___	GG	___	___	___	___	___
3. _RUQ_1064	AT	___	___	AG	GG	___	___	___	CC	___	___	TT	AA	___
4. _RUQ_1064	___	AG	GG	___	___	AA	GG	AA	GG	AA	GG	___	___	CC
5. _RUQ_1064	___	CT	___	___	___	___	CC	TT	CC	AA	___	___	___	___

	127	128	129
1. _SCA9	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
2. _RUQ_1064	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
3. _RUQ_1064	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
4. _RUQ_1064	AC	AA	AA	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X
5. _RUQ_1064	___	___	___	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X	X_X

Center for Forestry Research and Technology Transfer Vietnam

1._SCA_9

Jocelyn De Wever et al., 2019

International Cocoa Quarantine Centre, Reading (ICQC,R) United Kingdom

2._SCA_9 RUQ 1064

Jocelyn De Wever et al., 2019

3._SCA_9 RUQ 1064

Lambert Motilal, 2023

4._SCA_9 RUQ 1064

Notes: Reading_Collection

5._SCA_9 RUQ 1064

Dapeng Zhang, 2014

Key to SNP Markers

Key to SNP Markers

1	TcSNP13	2	TcSNP19	3	TcSNP25	4	TcSNP28	5	TcSNP32
6	TcSNP33	7	TcSNP42	8	TcSNP49	9	TcSNP52	10	TcSNP60
11	TcSNP75	12	TcSNP90	13	TcSNP122	14	TcSNP131	15	TcSNP143
16	TcSNP144	17	TcSNP150	18	TcSNP151	19	TcSNP154	20	TcSNP174
21	TcSNP176	22	TcSNP189	23	TcSNP193	24	TcSNP194	25	TcSNP226
26	TcSNP230	27	TcSNP240	28	TcSNP242	29	TcSNP290	30	TcSNP305
31	TcSNP316	32	TcSNP329	33	TcSNP363	34	TcSNP364	35	TcSNP372
36	TcSNP413	37	TcSNP418	38	TcSNP421	39	TcSNP429	40	TcSNP430
41	TcSNP448	42	TcSNP469	43	TcSNP497	44	TcSNP519	45	TcSNP521
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111	TcSNP1270	112	TcSNP1275	113	TcSNP1293	114	TcSNP1309	115	TcSNP1383
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126	Tcm001s00947643	127	Tcm003s01336581	128	Tcm003s07402719	129	Tcm006s26664133